Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCRBV5S2A0A599 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV5S2A0A599 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCRBV5S2A0A599 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCRBV5S2A0A599 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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