Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGNBP1Q5YKI7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GGNBP1Q5YKI7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms