Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSNARE1Q96NA8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms