Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FAAH2-201ENST00000374900 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SVIPQ8NHG7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms