Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBB3Q13509 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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