Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHBDD3Q9Y3P4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms