Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC23A1Q9UHI7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC23A1Q9UHI7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC23A1Q9UHI7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC23A1Q9UHI7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC23A1Q9UHI7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC23A1Q9UHI7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC23A1Q9UHI7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC23A1Q9UHI7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms