Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
CSAG1Q6PB30 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms