Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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