Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.612e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.139e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.351e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.038e-9■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.81□□□□□ -11e-6■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.724e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.774e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.794e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.844e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.114e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.24e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-8■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 522.42■■□□□ 1.189e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 SETD5-214ENST00000463180 685 ntTSL 219.88■□□□□ 0.779e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 315.7■□□□□ 0.19e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 SETD5-207ENST00000415650 579 ntTSL 413.63□□□□□ -0.239e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 SETD5-221ENST00000478475 477 ntTSL 48.14□□□□□ -1.119e-7■■■□□ 18.1
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TARDBPQ13148 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.435e-9■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.545e-9■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.645e-9■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 TBC1D5-223ENST00000471679 435 ntTSL 422.9■■□□□ 1.266e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 420.46■□□□□ 0.876e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 413.71□□□□□ -0.216e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 313.26□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 413.26□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 18.1
TARDBPQ13148 FMNL1-212ENST00000592527 742 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.932e-7■■■□□ 18
TARDBPQ13148 FMNL1-210ENST00000592006 888 ntTSL 519.45■□□□□ 0.72e-7■■■□□ 18
TARDBPQ13148 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 18
TARDBPQ13148 FMNL1-203ENST00000585852 877 ntTSL 213.79□□□□□ -0.22e-7■■■□□ 18
TARDBPQ13148 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-7■■■□□ 18
TARDBPQ13148 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 18
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TARDBPQ13148 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-9■■■□□ 18
TARDBPQ13148 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 SMURF1-203ENST00000472627 825 ntTSL 214.68□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 MEIS2-209ENST00000558313 1088 ntTSL 513.32□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.922e-8■■■□□ 18
TARDBPQ13148 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-8■■■□□ 18
TARDBPQ13148 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.912e-8■■■□□ 18
TARDBPQ13148 PLXNA3-208ENST00000495040 421 ntTSL 526.88■■□□□ 1.892e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 18
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TARDBPQ13148 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 18
TARDBPQ13148 CELF1-221ENST00000543178 576 ntTSL 49.29□□□□□ -0.921e-7■■■□□ 18
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TARDBPQ13148 CLK3-227ENST00000570296 916 ntTSL 519.27■□□□□ 0.684e-10■■■□□ 17.9
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TARDBPQ13148 PIGU-203ENST00000438215 509 ntTSL 39.81□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 ZEB2-238ENST00000636820 9115 ntTSL 56.87□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 519.42■□□□□ 0.74e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.644e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 217.57■□□□□ 0.48e-10■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LASP1-207ENST00000581485 617 ntTSL 316.42■□□□□ 0.228e-10■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 316.16■□□□□ 0.188e-10■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.098e-10■■■□□ 17.9
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TARDBPQ13148 LASP1-208ENST00000584106 1167 ntTSL 213.4□□□□□ -0.268e-10■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.544e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.874e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.497e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 WT1-202ENST00000379077 3032 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.257e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.247e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.17e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 EHMT1-252ENST00000640639 1259 ntTSL 514.35□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 EHMT1-240ENST00000637318 2983 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-6■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 ZEB2-233ENST00000636179 8984 ntTSL 511.26□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 211.25□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 314.7□□□□□ -0.062e-6■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.788e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.68e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.558e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 215.27■□□□□ 0.038e-7■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.534e-16■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.564e-16■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.584e-16■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.914e-16■■■□□ 17.9
TARDBPQ13148 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 MED15-229ENST00000489651 3563 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.621e-14■■■□□ 17.8
TARDBPQ13148 NDUFA10-210ENST00000471378 582 ntTSL 39.64□□□□□ -0.878e-7■■■□□ 17.8
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