Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSHP23434 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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