Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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BRD3Q15059 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BRD3Q15059 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BRD3Q15059 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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