Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKX2-5P52952 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKX2-5P52952 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms