Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CFAP99D6REC4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms