Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FANCLQ9NW38 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms