Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCAF1Q9H7N4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms