Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPL1Q96FJ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms