Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIF4BQ2VIQ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF4BQ2VIQ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms