Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC5Q00444 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms