Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC2LQ9UL33 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms