Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC92Q53HC0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms