Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTLL9Q3SXZ7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TTLL9Q3SXZ7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms