Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms