Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE40O14503 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms