Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms