Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-6Q9BXR3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-6Q9BXR3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms