Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RBBP8Q99708 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms