Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FRMD7Q6ZUT3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FRMD7Q6ZUT3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms