Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NAE1Q13564 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NAE1Q13564 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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