Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms