Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALD1Q05682 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALD1Q05682 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms