Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P63132 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HERVK_113P63132 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms