Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SHOC2Q9UQ13 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SHOC2Q9UQ13 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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