Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RAB11FIP4Q86YS3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4Q86YS3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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