Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC171Q6TFL3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC171Q6TFL3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms