Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP6Q3SY56 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP6Q3SY56 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms