Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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