Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSK3BP49841 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GSK3BP49841 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms