Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POMPQ9Y244 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POMPQ9Y244 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POMPQ9Y244 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms