Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCTN4Q9UJW0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCTN4Q9UJW0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCTN4Q9UJW0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCTN4Q9UJW0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms