Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBE1Q9UJT0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBE1Q9UJT0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TUBE1Q9UJT0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBE1Q9UJT0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBE1Q9UJT0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms