Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NRBP1Q9UHY1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NRBP1Q9UHY1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRBP1Q9UHY1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRBP1Q9UHY1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRBP1Q9UHY1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms