Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD3Q9UBI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD3Q9UBI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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