Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms