Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK4Q9NYG8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNK4Q9NYG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK4Q9NYG8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 509.3 ms