Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZCCHC17Q9NP64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZCCHC17Q9NP64 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZCCHC17Q9NP64 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZCCHC17Q9NP64 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms