Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL1Q9BYD6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL1Q9BYD6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL1Q9BYD6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL1Q9BYD6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms