Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HIRIP3Q9BW71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HIRIP3Q9BW71 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HIRIP3Q9BW71 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
HIRIP3Q9BW71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HIRIP3Q9BW71 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms