Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS1Q99742 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS1Q99742 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS1Q99742 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms