Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
EP400Q96L91 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
EP400Q96L91 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
EP400Q96L91 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EP400Q96L91 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms