Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SERAC1Q96JX3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SERAC1Q96JX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SERAC1Q96JX3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SERAC1Q96JX3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms